Registro:
| Documento: | Tesis Doctoral |
| Título: | Metabolismo, función y regulación de RNAs no codificantes |
| Título alternativo: | Metabolism, function and regulation of non-coding RNAs |
| Autor: | Fuchs Wightman, Federico |
| Editor: | Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales |
| Lugar de trabajo: | Universidad de Buenos Aires - CONICET. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias (IFIBYNE).
|
| Fecha de defensa: | 2023-06-30 |
| Fecha en portada: | 2023 |
| Grado Obtenido: | Doctorado |
| Título Obtenido: | Doctor de la Universidad de Buenos Aires en el área de Ciencias Biológicas |
| Departamento Docente: | Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular |
| Director: | De La Mata, Manuel |
| Consejero: | Srebrow, Anabella |
| Jurado: | Zanetti, María Eugenia; Boccaccio, Graciela Lidia; Manavella, Pablo |
| Idioma: | Español |
| Palabras clave: | ARNs CIRCULARES; microARNs; TDMD; ESPONJAcircRNAs; microRNAs; TDMD; SPONGE |
| Formato: | PDF |
| Handle: |
https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n7347_FuchsWightman |
| PDF: | https://bibliotecadigital.exactas.uba.ar/download/tesis/tesis_n7347_FuchsWightman.pdf |
| Registro: | https://bibliotecadigital.exactas.uba.ar/collection/tesis/document/tesis_n7347_FuchsWightman |
| Ubicación: | BIO 007347 |
| Derechos de Acceso: | Esta obra puede ser leída, grabada y utilizada con fines de estudio, investigación y docencia. Es necesario el reconocimiento de autoría mediante la cita correspondiente. Fuchs Wightman, Federico. (2023). Metabolismo, función y regulación de RNAs no codificantes. (Tesis Doctoral. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales). Recuperado de https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n7347_FuchsWightman |
Resumen:
Los ARNs circulares (circRNAs) han sido propuestos como "esponjas" o bloqueadores de microRNAs, una propiedad compartida con los ARNs lineales. Alternativamente, ciertos ARNs inducen la degradación de microRNAs a través del proceso de Degradación de microRNAs Dirigida por su ARN blanco (Target Directed MicroRNA Degradation, o TDMD). Se desconoce si los transcriptos lineales y circulares son equivalentes a la hora de desencadenar el mecanismo de TDMD. En este trabajo, demostramos que la topología del ARN puede ser determinante para la vía de TDMD. A través de un nuevo sistema que expresa un circRNA mientras se reduce el ARN lineal coexpresado, demostramos que los circRNAs difieren en su capacidad de desencadenar TDMD en relación a sus contrapartes lineales: algunos ARNs circulares no pueden inducir TDMD mientras que las secuencias lineales equivalente sí, y viceversa en otros casos. Ampliamos esta noción al examinar al par previamente bien estudiado de miR-7 y Cdr1as. Basándonos en el conocimiento anterior de que el ARN circular Cdr1as protege a miR-7 del TDMD mediado por Cyrano, demostramos que tanto la depleción de Cdr1as como la sobreexpresión de una versión lineal artificial de Cdr1as impulsan la degradación de miR-7, consistente con una actividad de TDMD diferencial entre ambas topologías. Al analizar los datos de secuenciación de ARN de un sistema de diferenciación neuronal, detectamos posibles eventos de regulación post-transcripcional de microRNA mediados por circRNAs, que sugieren que este tipo de regulación puede estar más extendido de lo que se pensaba anteriormente.
Abstract:
Circular RNAs (circRNAs) have been proposed to “sponge” or block microRNAs, a property shared with linear RNAs. Alternatively, certain RNAs induce microRNA destruction through the process of Target RNA-Directed MicroRNA Degradation (TDMD). Whether both linear and circular transcripts are equivalent in driving TDMD is unknown. Here we show that RNA topology may be determinant for TDMD. Through a novel system that expresses a circRNA while reducing the co-expressed cognate linear RNA, we show that circRNAs differ in their ability to trigger TDMD relative to their linear counterparts: some circular RNAs cannot induce TDMD while their linear equivalent sequences can, and vice versa in other cases. We further explored this notion by seizing the previously well studied pair of miR-7 and Cdr1as. Based on the previous knowledge that Cdr1as circular RNA protects miR-7 from Cyrano-mediated TDMD, we demonstrate that both depletion of Cdr1as and overexpression of an artificial linear version of Cdr1as drive miR-7 degradation, consistent with a differential TDMD activity between topologies. By analysing RNA sequencing data of a neuron differentiation system, we detect potential events of circRNA-mediated posttranscriptional microRNA regulation, suggesting that this kind of regulation might be more widespread than originally thought.
Citación:
---------- APA ----------
Fuchs Wightman, Federico. (2023). Metabolismo, función y regulación de RNAs no codificantes. (Tesis Doctoral. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.). Recuperado de https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n7347_FuchsWightman
---------- CHICAGO ----------
Fuchs Wightman, Federico. "Metabolismo, función y regulación de RNAs no codificantes". Tesis Doctoral, Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, 2023.https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n7347_FuchsWightman
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