Evaluación de identificaciones taxonómicas mediante código de barras del ADN en un grupo tropical megadiverso

Labarque, Facundo Martín

Registro:

Documento:	Tesis Doctoral
Disciplina:	biologia
Título:	Evaluación de identificaciones taxonómicas mediante código de barras del ADN en un grupo tropical megadiverso
Título alternativo:	Use of DNA barcoding techniques for rapid inventorying in a tropical megadiverse group
Autor:	Labarque, Facundo Martín
Editor:	Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Filiación:	Museo Argentino de Ciencias Naturales "Bernardino Rivadavia". División de Aracnología
Publicación en la Web:	2015-05-04
Fecha de defensa:	2012-04-11
Fecha en portada:	2012-02-06
Grado Obtenido:	Doctorado
Título Obtenido:	Doctor de la Universidad de Buenos Aires en el área de Ciencias Biológicas
Director:	Ramírez, Martín Javier
Director Asistente:	Arnedo, Miguel Angel
Consejero:	Roccatagliata, Daniel
Jurado:	Tubaro, Pablo; Marvaldi, Adriana; Cigliano, María M.
Idioma:	Español
Palabras clave:	DIVERSIDAD; SISTEMATICA; ARAÑAS; THERIDIOSOMATIDAEBIODIVERSITY; SYSTEMATICS; SPIDERS; THERIDIOSOMATIDAE
Tema:	biología/sistemática animal biología/genética de poblaciones biología/biodiversidad
Formato:	PDF
Handle:	http://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n5112_Labarque
PDF:	https://bibliotecadigital.exactas.uba.ar/download/tesis/tesis_n5112_Labarque.pdf
Registro:	https://bibliotecadigital.exactas.uba.ar/collection/tesis/document/tesis_n5112_Labarque
Ubicación:	Dep.BIO 005112
Derechos de Acceso:	Esta obra puede ser leída, grabada y utilizada con fines de estudio, investigación y docencia. Es necesario el reconocimiento de autoría mediante la cita correspondiente. Labarque, Facundo Martín. (2012). Evaluación de identificaciones taxonómicas mediante código de barras del ADN en un grupo tropical megadiverso. (Tesis Doctoral. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.). Recuperado de http://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n5112_Labarque

Resumen:

El objetivo principal del proyecto fue evaluar las ventajas y limitaciones de los códigosde barras del ADN y de los métodos de la taxonomía clásica al estudiar la diversidad dearañas en los bosques montanos de Panamá. Se procesaron 29961 especímenes dearañas de 49 familias, de los cuales el 60% son juveniles, se secuenciaron 3553fragmentos de cox1 y se generaron las bases de datos morfológica y molecularrespectivas. Se identificaron los especímenes mediante tres estrategias concatenadas. Primero una identificación rápida utilizando caracteres somáticos externos, seguidapor una identificación de grupos moleculares obtenidos con el modelo Generalizado Mixto de Yule y Coalescencia, finalizando con una identificación integrativa fruto de lacomparación recíproca de las anteriores y del aporte de la disección de los órganossexuales que son críticos a la hora de delimitar especies en artrópodos. Seidentificaron 548 especies de manera integrativa, se estimó la diversidad alfa y betasegún cada estrategia con los individuos adultos y, por primera vez, con los estadiosinmaduros identificados molecularmente; se realizó una revisión taxonómica integradade la familia Theridiosomatidae con el aporte de dos géneros nuevos y 27 especiesnuevas y se asociaron los sacos de huevos con sus adultos mediante los códigos debarra, y se evaluaron las metodologías de colecta. Los códigos de barra sirvieron paraestimar la diversidad, asociar diferentes estadios entre sí como machos y hembras yjuveniles con sus adultos, revelar haplotipos endémicos, y sugirieron especies crípticasy nuevas especies putativas a partir de los estadios inmaduros no encontrados entrelos adultos.

Abstract:

The main goal of the project was to evaluate the advantages and limitations of DNAbarcoding and traditional taxonomy to study the spider diversity in the montaneforests of Panama. We have sorted 29961 specimens of 49 families, 60% of which wereimmature, and we have sequenced 3553 cox1 fragments, to generate morphologicaland molecular data bases. Specimens were identified using three linked approaches. First, a fast identification approach using external somatic characters, followed by a General Mixed Yule‐Coalescent molecular cluster identification, ending with thereciprocal illumination of both previous approaches plus a close examination of sexualorgans, known as critic characters to delimit arthropods species, called integrativeidentification. We have identified 548 integrative species, we have estimated alphaand beta diversity with adults using each identification approach and, for the first time,we also have used immature specimens. We have done a taxonomic integrativerevision of the family Theridiosomatidae describing two new genera and 27 newspecies plus spider egg‐sacs association with their species using DNA barcodes, and wehave evaluated collecting methods. DNA barcodes can be used to estimate diversity, toassociate different life and gender stages such as immature to mature and male tofemale specimens, and to reveal endemic haplotypes. DNA barcodes also suggestcryptic species, and putative new species from immature specimens not found amongadults.

Citación:

---------- APA ----------

Labarque, Facundo Martín. (2012). Evaluación de identificaciones taxonómicas mediante código de barras del ADN en un grupo tropical megadiverso. (Tesis Doctoral. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.). Recuperado de https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n5112_Labarque

---------- CHICAGO ----------

Labarque, Facundo Martín. "Evaluación de identificaciones taxonómicas mediante código de barras del ADN en un grupo tropical megadiverso". Tesis Doctoral, Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, 2012.https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n5112_Labarque

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