Rol de la RNA polimerasa II en la regulación del splicing alternativo de genes eucariotas

De La Mata, Manuel

Registro:

Documento:	Tesis Doctoral
Título:	Rol de la RNA polimerasa II en la regulación del splicing alternativo de genes eucariotas
Autor:	De La Mata, Manuel
Editor:	Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Publicación en la Web:	2023-05-09
Fecha de defensa:	2006
Fecha en portada:	2006
Grado Obtenido:	Doctorado
Título Obtenido:	Doctor de la Universidad de Buenos Aires en el área de Ciencias Biológicas
Departamento Docente:	Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular
Director:	Kornblihtt, Alberto Rodolfo
Idioma:	Español
Formato:	PDF
Handle:	http://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n4018_DeLaMata
PDF:	https://bibliotecadigital.exactas.uba.ar/download/tesis/tesis_n4018_DeLaMata.pdf
Registro:	https://bibliotecadigital.exactas.uba.ar/collection/tesis/document/tesis_n4018_DeLaMata
Ubicación:	BIO 004018
Derechos de Acceso:	Esta obra puede ser leída, grabada y utilizada con fines de estudio, investigación y docencia. Es necesario el reconocimiento de autoría mediante la cita correspondiente. De La Mata, Manuel. (2006). Rol de la RNA polimerasa II en la regulación del splicing alternativo de genes eucariotas. (Tesis Doctoral. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales). Recuperado de http://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n4018_DeLaMata

Resumen:

La transcripción y el procesamiento del mRNA ocurren coordinadamente en la célula. La RNA polimerasa II (pol II) se halla en el centro de este acoplamiento y puede dirigir tanto la síntesis de mensajeros como su procesamiento simultáneo. En esta tesis se estudiaron dos modos generales de regulación del splicing alternativo en los cuales la pol II juega un papel central. Demostramos que una mutante lenta de pol II afecta el splicing alternativo tanto de genes transfectados transitoriamente como de genes endógenos. Esto constituye una prueba directa del control de la elongación sobre el splicing alternativo in vivo. Por otro lado se encontró que el dominio carboxilo terminal (CTD) de la pol II regula el splicing alternativo del exón EDI de la fibronectina. Se demostró que el CTD es necesario para que una proteína de la familia SR, SRp20, ejerza su acción negativa sobre la inclusión de EDI, mientras que la acción estimulante sobre la inclusión de EDI de otra proteína SR, SF2/ASF, es independiente del CTD. Esto sugiere que el CTD actúa reclutando a SRp20 y no a SF2/ASF a la proximidad de EDI, llevando a la exclusión del mismo. Se sabe que la fosforilación del CTD controla la elongación de la pol II. Sin embargo, el efecto inhibitorio de SRp20 persiste cuando la elongación se encuentra reducida en presencia de la pol II lenta o por la droga DRB. Estos resultados sugieren que la elongación y el reclutamiento de factores de splicing contribuyen independientemente al control transcripcional del splicing alternativo.

Abstract:

Transcription and mRNA processing occur in a highly coordinated manner within the cell. RNA polymerase II (pol II) lies in the center of this coupling and is capable of carrying both the synthesis of mRNAs and their simultaneous processing. In this Thesis we studied two general modes of alternative splicing regulation where pol II plays a central role. We demonstrate that a slow pol II mutant affects alternative splicing of both transiently transfected minigenes and endogenous genes. These results provide a direct proof for the elongation control of alternative splicing in vivo. Additionally, we found that the carboxy-terminal domain (CTD) of pol II regulates the alternative splicing of fibronectin EDI exon. We found that the CTD is required for the inhibitory action of the SR protein SRp20 on the inclusion of EDI into the mature mRNA, whereas SR protein SF2/ASF stimulates EDI inclusion in a CTD-independent manner. This suggests that the CTD acts by recruiting SRp20 but not SF2/ASF to the vicinity of EDI leading to exon skipping. CTD phosphorylation controls transcription elongation which is a major contributor to alternative splicing regulation. However, the SRp20 effect is still observed when transcription elongation is reduced by the slow pol II or DRB. These results suggest that elongation and splicing factor recruitment contribute independently to the transcriptional control of alternative splicing.

Citación:

---------- APA ----------

De La Mata, Manuel. (2006). Rol de la RNA polimerasa II en la regulación del splicing alternativo de genes eucariotas. (Tesis Doctoral. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.). Recuperado de https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n4018_DeLaMata

---------- CHICAGO ----------

De La Mata, Manuel. "Rol de la RNA polimerasa II en la regulación del splicing alternativo de genes eucariotas". Tesis Doctoral, Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, 2006.https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n4018_DeLaMata

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