Registro:
| Documento: | Tesis de Grado |
| Título: | Control de la elongación de la transcripción sobre el splicing alternativo en C. elegans |
| Título alternativo: | Transcriptional elongation control of alternative splicing in C. elegans |
| Autor: | Monti, Gonzalo |
| Editor: | Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales |
| Lugar de trabajo: | Universidad de Buenos Aires - CONICET. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias (IFIBYNE)
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| Publicación en la web: | 2025-06-12 |
| Fecha de defensa: | 2023-12-06 |
| Fecha en portada: | Octubre 2023 |
| Grado Obtenido: | Grado |
| Título Obtenido: | Licenciado en Ciencias Biológicas |
| Departamento Docente: | Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular |
| Director: | Godoy Herz, Micaela Amalia |
| Jurado: | Cánepa, Eduardo Tomás; Brocco, Marcela Adriana; Blaustein Kkappelmacher, Matias |
| Idioma: | Español |
| Formato: | PDF |
| Handle: |
http://hdl.handle.net/20.500.12110/seminario_nBIO001679_Monti |
| PDF: | https://bibliotecadigital.exactas.uba.ar/download/seminario/seminario_nBIO001679_Monti.pdf |
| Registro: | https://bibliotecadigital.exactas.uba.ar/collection/seminario/document/seminario_nBIO001679_Monti |
| Ubicación: | Dep.BIO 001679 |
| Derechos de Acceso: | Esta obra puede ser leída, grabada y utilizada con fines de estudio, investigación y docencia. Es necesario el reconocimiento de autoría mediante la cita correspondiente. Monti, Gonzalo. (2023). Control de la elongación de la transcripción sobre el splicing alternativo en C. elegans. (Tesis de Grado. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.). Recuperado de http://hdl.handle.net/20.500.12110/seminario_nBIO001679_Monti |
Resumen:
La regulación del splicing alternativo dada por cambios en la elongación de la transcripción es un proceso que ha sido estudiado en células animales en cultivo y en plantas pero no así en organismos animales enteros. El nematodo C. elegans es un modelo sencillo para estudiar splicing alternativo, debido a su rápido desarrollo, fácil manejo y la existencia de técnicas simples para silenciar sus genes. Entre estas últimas, se encuentra la técnica de RNAi vía alimentación, que consiste en alimentar a los gusanos con bacterias transformadas con plásmidos que expresan dsRNAs. El objetivo de este trabajo consiste en estudiar si la elongación de la transcripción juega un rol en la regulación del splicing alternativo en C. elegans. Para ello, realizamos experimentos con drogas que afectan la elongación de la transcripción, y se puso a punto la técnica de RNAi vía alimentación, con el objetivo final de utilizarla para silenciar factores de elongación de la transcripción. Encontramos que el tratamiento con camptotecina, que reduce la elongación de la transcripción, aumenta la inclusión del exón alternativo del factor de splicing hrpf-1. Por otro lado, el tratamiento con tricostatina A, que aumenta la elongación de la transcripción, disminuye la inclusión del exón alternativo de hrpf-1. Además, se puso a punto correctamente la técnica de RNAi vía alimentación, y se lograron silenciar con éxito los factores de elongación rtfo-1, pafo-1 y tfiis. El silenciamiento de tfiis aumentó la inclusión del microexón de un gen codificante para un canal de potasio, kvs-5. Estos resultados son consistentes con que la elongación de la transcripción regula el splicing alternativo de ciertos genes en C. elegans, y la puesta a punto de la técnica de RNAi vía alimentación permitirá realizar experimentos silenciando factores de elongación, splicing o incluso isoformas específicas.
Abstract:
The regulation of alternative splicing via transcriptional elongation is a wellknown process that has been studied in animal cell cultures and in plants. However, this mode of regulation has not yet been investigated in whole animals. The nematode C. elegans is a useful model for studying alternative splicing, given its fast development and availability of easy-to-use techniques for gene silencing. One of these techniques is RNAi by feeding, which consists of feeding the worms with E. coli that have been transformed with a vector expressing dsRNAs. In this work, we aim to study if transcriptional elongation plays a role in alternative splicing regulation in C. elegans. In order to explore this, worms were treated with drugs that affect transcriptional elongation. In addition, we decided to fine-tune the RNAi by feeding technique and use it to silence transcription elongation factors. Treatment with camptothecin, which reduces transcriptional elongation, increases splicing factor hrpf-1 alternative exon inclusion. On the other hand, treatment with trichostatin A, a drug that increases transcriptional elongation, reduces hrpf-1 alternative exon inclusion. In addition, the RNAi by feeding technique was correctly fine-tuned and was used to effectively silence the elongation factors rtfo-1, pafo-1 and tfiis. Tfiis silencing increased microexon inclusion of kvs-5, which encodes a potassium channel subunit. These results are consistent with transcriptional elongation regulating alternative splicing of certain genes in C. elegans. The correct fine-tuning of the RNAi by feeding technique allows for future experiments regarding silencing of transcriptional elongation factors, as well as splicing factors and even specific isoforms of certain genes.
Citación:
---------- APA ----------
Monti, Gonzalo. (2023). Control de la elongación de la transcripción sobre el splicing alternativo en C. elegans. (Tesis de Grado. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.). Recuperado de https://hdl.handle.net/20.500.12110/seminario_nBIO001679_Monti
---------- CHICAGO ----------
Monti, Gonzalo. "Control de la elongación de la transcripción sobre el splicing alternativo en C. elegans". Tesis de Grado, Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, 2023.https://hdl.handle.net/20.500.12110/seminario_nBIO001679_Monti
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