Se realizaron simulaciones Monte Carlo para estudiar la estabilidad del cluster hidrofóbico y del esqueleto peptídico de una horquilla β (β-hairpin) de la proteína G de Streptococcus. El cluster hidrofóbico resultó inestable tanto en vacío como en solvente acuoso mientras que el patrón de enlaces de hidrógeno intracatenarios, analizado solo en vacío pero a diferentes temperaturas, demostró una importante estabilidad. Los resultados de estas simulaciones de desestabilización de la horquilla nativa sugieren que, si se evaluara el proceso de plegamiento de esta estructura, la estabilidad se conseguiría principalmente a través de la formación de los enlaces de hidrógeno intracatenarios, mientras que la formación del cluster hidrofóbico quedaría en un plano complementario respecto al aporte de estabilidad. La mutación de un residuo por otro aún más hidrofóbico aumenta la estabilidad de dicho cluster
In order to study the hydrophobic cluster and backbone stability of a β-hairpin of the G protein, Monte Carlo simulations were performed. Both in vacuo and explicit solvent the hydrophobic cluster proved to be unstable while the backbone hydrogen bond pattern (analized only in vacuo but at different temperatures) showed significant stability. The results of simulations from the native structure suggest thatin the folding process of β-hairpin, stability is essentially achieved by formation of the backbone hydrogen bonds while the formation of hydrophobic cluster only contribute in a complementary way to the systemstability. The mutation of a cluster residue for another even more hydrophobic increases the stability of the cluster
| Título: | Estudio de la estabilidad del cluster hidrofóbico de la horquilla beta de una proteína utilizando el método Monte Carlo |
| Autor: | Nicastro, Alcides; Sferco, Silvano Juan |
| Fecha: | 2004 |
| Título revista: | Anales AFA |
| Editor: | Asociación Física Argentina |
| Handle: | http://hdl.handle.net/20.500.12110/afa_v16_n01_p242 |
| Ciudad: | Villa Martelli, Buenos Aires |
| Idioma: | Español |
| Año: | 2004 |
| Volumen: | 16 |
| Número: | 01 |
| Título revista abreviado: | An. (Asoc. Fís. Argent., En línea) |
| ISSN: | 1850-1168 |
| Formato: | |
| PDF: | https://bibliotecadigital.exactas.uba.ar/download/afa/afa_v16_n01_p242.pdf |
| Registro: | https://bibliotecadigital.exactas.uba.ar/collection/afa/document/afa_v16_n01_p242 |
